Τo χρονικό διάστημα 1996-2008 από το Επιχειρησιακό πρόγραμμα (ΕΠΕΑΕΚ) του Υπουργείου Παιδείας ενισχύονται πιλοτικές δράσεις για την παροχή νέων υπηρεσιών που οδηγούν στην ουσιαστική αναβάθμιση των υποδομών των Βιβλιοθηκών.
Στο πλαίσιο αυτό, αφού εξασφαλίστηκαν πόροι από το ανωτέρω πρόγραμμα οι υπάρχουσες βιβλιοθήκες τμημάτων και τομέων υπάγονται διοικητικά και λειτουργικά σε μία από τις ακόλουθες οκτώ Βιβλιοθήκες Σχολών: